187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3249 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  100 
 
 		 387 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  60.36 
 
 		 386 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  60 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  57.88 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  61.62 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  59.48 
 
 		 405 aa  461  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  59.84 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  58.18 
 
 		 385 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  59.84 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  59.84 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  59.84 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  59.06 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  59.06 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  58.79 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  59.32 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  62.73 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  59.06 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  59.58 
 
 		 382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  59.84 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  58.53 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  59.58 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  59.16 
 
 		 383 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  59.16 
 
 		 383 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  59.16 
 
 		 383 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  59.63 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  57.53 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  60.38 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  60.16 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  50.9 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  51.16 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  53.3 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  48.33 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  51.13 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  49.74 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  49.87 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  49.1 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  49.1 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  49.47 
 
 		 391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  46.63 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  50.26 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  43.96 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  43.7 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  45.38 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  43.7 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  43.7 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  43.7 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  50.91 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  43.19 
 
 		 381 aa  316  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  43.44 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  43.41 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  42.16 
 
 		 381 aa  308  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  42.16 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  42.74 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  45.11 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  41.09 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  46.48 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  43.6 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  45.92 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.19 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  47.27 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  42.63 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  37.98 
 
 		 381 aa  272  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  46.59 
 
 		 376 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  39.03 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  40.21 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  36.92 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  36.92 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.8 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  45.38 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.51 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  44.99 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.52 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.29 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.5 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  43.54 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  41.83 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.18 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  36.08 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  35.46 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.94 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  41.12 
 
 		 358 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  37.13 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  41.62 
 
 		 356 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  38.07 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  42.51 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  39.83 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.74 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  40.62 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  42.86 
 
 		 418 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  40.39 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  44.75 
 
 		 349 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  43.27 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  38.94 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  38.46 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  38.3 
 
 		 396 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  40.9 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  39.19 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  43.23 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  36.7 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  41.6 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>