More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0831 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  84.71 
 
 		 402 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 		 400 aa  806    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  81.11 
 
 		 401 aa  663    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.5 
 
 		 400 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.75 
 
 		 400 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83 
 
 		 402 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  85.75 
 
 		 400 aa  684    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 		 400 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82.96 
 
 		 401 aa  675    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  85.5 
 
 		 400 aa  709    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.5 
 
 		 401 aa  680    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.71 
 
 		 401 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.75 
 
 		 400 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  95.5 
 
 		 400 aa  778    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  97.5 
 
 		 400 aa  788    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  84.46 
 
 		 403 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  88.19 
 
 		 401 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.75 
 
 		 400 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.5 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 405 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3548  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.17 
 
 		 403 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.5 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 405 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 405 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.5 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 405 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.75 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 405 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2871  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82.91 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.25 
 
 		 400 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76 
 
 		 400 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.75 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.75 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.75 
 
 		 406 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.75 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.31 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.95 
 
 		 404 aa  595  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.5 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.5 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.25 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.82 
 
 		 401 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.83 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  75.56 
 
 		 401 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.32 
 
 		 406 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.32 
 
 		 406 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.75 
 
 		 401 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.82 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.75 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.93 
 
 		 400 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.33 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.75 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.58 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.33 
 
 		 401 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.5 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.64 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.25 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.82 
 
 		 401 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.68 
 
 		 400 aa  557  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.39 
 
 		 406 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70 
 
 		 399 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.25 
 
 		 399 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.5 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.32 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.33 
 
 		 401 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  67.75 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.08 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.57 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.83 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.58 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.32 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.83 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.25 
 
 		 405 aa  535  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3817  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.85 
 
 		 400 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.342628  normal  0.265145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 		 401 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.42 
 
 		 401 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>