More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0809 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  31.29 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.7 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  29.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.7 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.7 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.77 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.52 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  32.35 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.56 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.88 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.64 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.28 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  29.28 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  29.28 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.28 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  29.28 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.5 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.06 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.9 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.93 
 
 		 372 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  28.3 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.44 
 
 		 372 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  27.51 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  27.51 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>