More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1188 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  47.49 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  41.95 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  41.63 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  38.99 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  39.44 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.98 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.98 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.98 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.51 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33.16 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.61 
 
 		 203 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.84 
 
 		 203 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.84 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.49 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.46 
 
 		 442 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.46 
 
 		 442 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.93 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.02 
 
 		 442 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  31.48 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  32.02 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  32.56 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  32.56 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.83 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.71 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.96 
 
 		 442 aa  82  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  30.67 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.03 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.91 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.47 
 
 		 444 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.11 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.85 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  31.21 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  32.37 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.29 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.14 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  31.87 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  24.75 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.19 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.19 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.91 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.23 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.96 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>