More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0745 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  68 
 
 		 99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  68.63 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  67.65 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  67 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  63.37 
 
 		 102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  54.81 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 103 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.85 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  55.45 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  52.38 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 102 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  45.79 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  46.73 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>