More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2021 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
479 aa  989    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  47.86 
 
 
473 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.9 
 
 
484 aa  428  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  42.47 
 
 
490 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.48 
 
 
492 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.21 
 
 
481 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.69 
 
 
481 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.67 
 
 
482 aa  353  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.96 
 
 
482 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.96 
 
 
481 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.54 
 
 
481 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.75 
 
 
482 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.59 
 
 
481 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.67 
 
 
482 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.34 
 
 
482 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  39.88 
 
 
482 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.24 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.92 
 
 
510 aa  305  9.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.82 
 
 
500 aa  279  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.21 
 
 
503 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.73 
 
 
451 aa  256  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
499 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.11 
 
 
453 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.03 
 
 
491 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.72 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.72 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
508 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.54 
 
 
474 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.32 
 
 
498 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
505 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
508 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
494 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
508 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 
501 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.63 
 
 
496 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.15 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 
504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29 
 
 
496 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29 
 
 
496 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
518 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.73 
 
 
529 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
511 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 
501 aa  213  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
502 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.17 
 
 
513 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.66 
 
 
503 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
509 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
515 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
520 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.65 
 
 
528 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 
509 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 
512 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 
515 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.46 
 
 
579 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
1043 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
620 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
509 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
490 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.77 
 
 
516 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.35 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  29.82 
 
 
532 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.54 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.54 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.54 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.42 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.42 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.42 
 
 
556 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
554 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 
526 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.8 
 
 
525 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.28 
 
 
519 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 
561 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
525 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 
522 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.27 
 
 
525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.05 
 
 
526 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  27.58 
 
 
514 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 
521 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  27.6 
 
 
527 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
524 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 
512 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.94 
 
 
527 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 
518 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
530 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.54 
 
 
570 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.31 
 
 
525 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 
506 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 
511 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.77 
 
 
525 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 
528 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.37 
 
 
526 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
496 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 
535 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>