More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0202 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  78.04 
 
 		 267 aa  349  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  75.23 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  69.51 
 
 		 217 aa  307  9e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  68.16 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  67.26 
 
 		 218 aa  298  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  66.97 
 
 		 222 aa  294  8e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  61.88 
 
 		 226 aa  288  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  64.41 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  63.96 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  63.06 
 
 		 217 aa  280  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  63.06 
 
 		 217 aa  280  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  62.33 
 
 		 217 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  58.64 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  57.73 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  58.11 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  57.53 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  58.9 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  58.72 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  57.27 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  53.81 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 219 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  54.26 
 
 		 222 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  54.26 
 
 		 222 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  56.05 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  53.95 
 
 		 245 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  58.33 
 
 		 229 aa  247  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 211 aa  247  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  52.47 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  57.87 
 
 		 229 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  56.39 
 
 		 229 aa  245  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  53.18 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 230 aa  244  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 211 aa  244  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  57.41 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  51.82 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  50.67 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  50.67 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  55.09 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 231 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  54.63 
 
 		 232 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  56.02 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 232 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>