105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  100 
 
 		 631 aa  1229    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  40.7 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  41.62 
 
 		 718 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  44.58 
 
 		 708 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  42.16 
 
 		 739 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  41.38 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  41.52 
 
 		 722 aa  402  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  45.37 
 
 		 671 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  40.77 
 
 		 708 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  39.4 
 
 		 651 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  40.03 
 
 		 687 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  39.18 
 
 		 687 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  40.75 
 
 		 671 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  39.14 
 
 		 686 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  37.54 
 
 		 678 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.81 
 
 		 683 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  40.06 
 
 		 711 aa  343  8e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  40.03 
 
 		 681 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  38 
 
 		 752 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.46 
 
 		 731 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  39.62 
 
 		 665 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  39.62 
 
 		 665 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  39.62 
 
 		 665 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.03 
 
 		 675 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  38.57 
 
 		 664 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  38.5 
 
 		 692 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  40.25 
 
 		 691 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  40.29 
 
 		 679 aa  320  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  40.9 
 
 		 651 aa  319  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  39.69 
 
 		 676 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  44.94 
 
 		 672 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.48 
 
 		 719 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  36.22 
 
 		 736 aa  244  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  42.81 
 
 		 661 aa  241  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.86 
 
 		 632 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  35.17 
 
 		 642 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  33.39 
 
 		 646 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  32.78 
 
 		 637 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  33.93 
 
 		 641 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  33.93 
 
 		 641 aa  210  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  32.52 
 
 		 653 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.67 
 
 		 319 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  36.39 
 
 		 310 aa  169  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  37.63 
 
 		 328 aa  159  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.11 
 
 		 654 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  36.82 
 
 		 322 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  35.66 
 
 		 322 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  36.59 
 
 		 319 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  33.86 
 
 		 651 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  32.47 
 
 		 322 aa  124  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.88 
 
 		 613 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  29.14 
 
 		 331 aa  111  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.54 
 
 		 331 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.54 
 
 		 331 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.29 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  31.06 
 
 		 327 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.68 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.66 
 
 		 307 aa  95.5  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.71 
 
 		 326 aa  93.6  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  31.57 
 
 		 604 aa  87.8  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  26.01 
 
 		 394 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  22.9 
 
 		 265 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  22.02 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.44 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.44 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.02 
 
 		 277 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  33.68 
 
 		 273 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  27.54 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  21.65 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  36.59 
 
 		 343 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.52 
 
 		 343 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.08 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.22 
 
 		 544 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  34.07 
 
 		 551 aa  50.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  25.42 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25.33 
 
 		 315 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  35.96 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40.35 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 578 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.46 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.46 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  30.77 
 
 		 290 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  26.37 
 
 		 267 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.25 
 
 		 309 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  28.46 
 
 		 439 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.46 
 
 		 544 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.82 
 
 		 549 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  31.39 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.68 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  31.39 
 
 		 322 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  30.77 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  30.77 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  30.77 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  31.3 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  31.39 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.53 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.09 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>