225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  100 
 
 
252 aa  506  1e-142  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 
254 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  65.06 
 
 
250 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  55.56 
 
 
252 aa  293  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  57.14 
 
 
256 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  59.44 
 
 
251 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  58.17 
 
 
254 aa  282  5e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  58.63 
 
 
251 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  54.18 
 
 
254 aa  275  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  57.6 
 
 
254 aa  273  1e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  55.56 
 
 
252 aa  273  2e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 
252 aa  271  5e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 
255 aa  271  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 
254 aa  271  7e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  56.97 
 
 
254 aa  271  8e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  56.97 
 
 
254 aa  271  8e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  56.97 
 
 
254 aa  271  8e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.06 
 
 
253 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  54.84 
 
 
253 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  58.13 
 
 
257 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  54.94 
 
 
254 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  55.25 
 
 
258 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  60.08 
 
 
252 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  56.35 
 
 
252 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 
255 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  57.03 
 
 
301 aa  262  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  55.42 
 
 
249 aa  259  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  56.63 
 
 
255 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 
255 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.63 
 
 
258 aa  251  8e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  56.75 
 
 
304 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 
264 aa  247  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  51.97 
 
 
299 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
254 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
255 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  52.24 
 
 
250 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
257 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
249 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
255 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 
255 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
254 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
249 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 
255 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 
250 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.23 
 
 
257 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 
255 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 
255 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  48.76 
 
 
251 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  47.92 
 
 
250 aa  219  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 
255 aa  220  2e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  47.13 
 
 
250 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 
273 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  46.12 
 
 
247 aa  216  3e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  47.72 
 
 
251 aa  216  3e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 
250 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 
256 aa  214  1e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  50.61 
 
 
256 aa  213  3e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  47.3 
 
 
259 aa  212  4e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.87 
 
 
255 aa  212  4e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 
256 aa  212  4e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 
256 aa  212  4e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
252 aa  211  8e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  47.81 
 
 
260 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 
256 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.88 
 
 
252 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  48.98 
 
 
260 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 
261 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  41.22 
 
 
256 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 
253 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 
258 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.23 
 
 
253 aa  208  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 
258 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  50.41 
 
 
254 aa  207  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 
253 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.22 
 
 
255 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  47.62 
 
 
260 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  44 
 
 
256 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 
253 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 
255 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
255 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.82 
 
 
255 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 
259 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 
253 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 
250 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  41.98 
 
 
253 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 
255 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 
253 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  41.56 
 
 
253 aa  204  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 
256 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 
254 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40 
 
 
255 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  47.83 
 
 
270 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 
253 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 
249 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  42.46 
 
 
252 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
256 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1497  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 
246 aa  201  1e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.910801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>