More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0454 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  50.64 
 
 
243 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  50 
 
 
246 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  50.21 
 
 
242 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  46.89 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  46.89 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  48.98 
 
 
256 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  46.86 
 
 
239 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  50 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  47.39 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  44.77 
 
 
257 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  50.93 
 
 
247 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
275 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 
252 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  40 
 
 
263 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  41.53 
 
 
255 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  47.42 
 
 
271 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36.18 
 
 
259 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  39.46 
 
 
257 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  43.55 
 
 
270 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  41.49 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  38.98 
 
 
259 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
260 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 
256 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.92 
 
 
308 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  38.02 
 
 
255 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  37.9 
 
 
255 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  40 
 
 
265 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.74 
 
 
280 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
252 aa  98.6  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  33.99 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  33.99 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  33.99 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  33.99 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  40.56 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  32.79 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  38.12 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  27.64 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  35.5 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  34.4 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  44 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  41.38 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  42.14 
 
 
249 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  29.49 
 
 
333 aa  86.3  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  43.55 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  40.14 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  48.41 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  45.97 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  44.8 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5336  hypothetical protein  31.84 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671975  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  40.32 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4001  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  33.09 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  35.29 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  44.35 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  29.22 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  39.69 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  32.64 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3479  methyltransferase type 11  48.31 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0924796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  40.15 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  47.9 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  34.85 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  45.56 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2382  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  39.23 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3499  Methyltransferase type 11  43.8 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  32.44 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  28.34 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  41.73 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  44.33 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  41.73 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29451  hypothetical protein  34.07 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  41.91 
 
 
457 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  35.94 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>