183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4229 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
108 aa  215  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  52.83 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.43 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.94 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  47.66 
 
 
247 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.94 
 
 
105 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  44.76 
 
 
105 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.76 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.52 
 
 
104 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  47.52 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.52 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.42 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  43.27 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.9 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000114439  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  39.42 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.49 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.14 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.32 
 
 
107 aa  77  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000352276  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  41.9 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.85 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.91 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.51 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  34.45 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.04 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.14 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  35.35 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.91 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.04 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  31.19 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000371113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  36 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  31.86 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  32.38 
 
 
115 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  37.25 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  38.38 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.15 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4578  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.48 
 
 
121 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  41.25 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  47.37 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  30.77 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.38 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.37 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2688  hypothetical protein  29 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.299941  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  33 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.66 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  30.77 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  48.98 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4730  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.06 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167387  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2585  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.45 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212728  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  35.64 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  45 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.93 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.3 
 
 
95 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  0.00000000510411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  40.3 
 
 
95 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000183319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 
97 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 
97 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.95 
 
 
97 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3717  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.29 
 
 
136 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.989758  hitchhiker  0.00118334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.35 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.63 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  31.78 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2199  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.09 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.927569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2329  H-NS histone family protein  38.05 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1305  hitchhiker  0.00000000912792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.61 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  30.58 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.76 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  0.0000000190695 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.35 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.82 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.82 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1351  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.4 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0110439  hitchhiker  0.00767889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.98 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.04 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1957  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.98 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.48 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1444  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.97 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.292783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.29 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.03 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0132  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  37.37 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6772  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.64 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000111168  normal  0.0541472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3984  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.93 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49889  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1981  global DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS  48.08 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.295466  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  38.03 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1416  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.4 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00233677  normal  0.422691 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.03 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1404  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.58 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773951  normal  0.9865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2856  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.63 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>