More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4125 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  100 
 
 
409 aa  838  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.1 
 
 
391 aa  184  2e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.63 
 
 
407 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.58 
 
 
411 aa  173  4e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.37 
 
 
415 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.41 
 
 
408 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.41 
 
 
408 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.41 
 
 
408 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.09 
 
 
426 aa  164  2e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.09 
 
 
430 aa  164  2e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.6 
 
 
412 aa  164  2e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.13 
 
 
440 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.49 
 
 
401 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.76 
 
 
426 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.81 
 
 
430 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.13 
 
 
431 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.78 
 
 
413 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.58 
 
 
402 aa  154  3e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.02 
 
 
421 aa  153  6e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.4 
 
 
421 aa  153  6e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.49 
 
 
400 aa  152  9e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.99 
 
 
423 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.77 
 
 
426 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.63 
 
 
424 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.23 
 
 
445 aa  149  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.9 
 
 
417 aa  148  2e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.9 
 
 
417 aa  148  2e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.9 
 
 
417 aa  148  2e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.97 
 
 
414 aa  148  2e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.57 
 
 
402 aa  147  2e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.14 
 
 
407 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.41 
 
 
405 aa  147  2e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.44 
 
 
404 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.33 
 
 
431 aa  147  4e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.16 
 
 
429 aa  146  7e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.42 
 
 
419 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.02 
 
 
403 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  32.98 
 
 
403 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.16 
 
 
433 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.51 
 
 
455 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.39 
 
 
428 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.16 
 
 
432 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  31.74 
 
 
432 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.17 
 
 
418 aa  142  1e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.17 
 
 
419 aa  141  2e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.71 
 
 
407 aa  140  4e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.7 
 
 
419 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.11 
 
 
426 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  31.04 
 
 
405 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.69 
 
 
433 aa  137  3e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  31.28 
 
 
413 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.75 
 
 
410 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.06 
 
 
411 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.56 
 
 
438 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  27.59 
 
 
431 aa  136  7e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  31.31 
 
 
415 aa  136  7e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.25 
 
 
441 aa  135  1e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  29.7 
 
 
432 aa  134  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.22 
 
 
436 aa  134  4e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.38 
 
 
417 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.83 
 
 
423 aa  132  1e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.49 
 
 
470 aa  132  1e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.93 
 
 
421 aa  132  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  30.85 
 
 
412 aa  131  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.09 
 
 
413 aa  132  2e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.92 
 
 
413 aa  130  5e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.64 
 
 
414 aa  129  7e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  30.35 
 
 
433 aa  129  8e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  30.47 
 
 
411 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  28.82 
 
 
480 aa  128  1e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  30.95 
 
 
394 aa  129  1e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.58 
 
 
459 aa  128  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.52 
 
 
444 aa  128  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.27 
 
 
411 aa  128  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.13 
 
 
420 aa  128  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 
443 aa  127  4e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.18 
 
 
413 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.03 
 
 
425 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  30.83 
 
 
429 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  30.71 
 
 
409 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  30.47 
 
 
411 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.46 
 
 
412 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.05 
 
 
416 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  29.84 
 
 
428 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.69 
 
 
434 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  28.88 
 
 
424 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.13 
 
 
391 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  29.58 
 
 
437 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  30.29 
 
 
425 aa  122  1e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
445 aa  122  1e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  29.65 
 
 
406 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  31.28 
 
 
444 aa  120  5e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.56 
 
 
413 aa  119  1e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.72 
 
 
426 aa  118  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  26.54 
 
 
412 aa  118  2e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  30.03 
 
 
444 aa  118  2e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  28.99 
 
 
450 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.99 
 
 
396 aa  115  1e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.75 
 
 
409 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.75 
 
 
409 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>