More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4066 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  51.25 
 
 		 1106 aa  959    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  51.34 
 
 		 1119 aa  964    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1120 aa  2226    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  50.31 
 
 		 1121 aa  947    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  50.71 
 
 		 1106 aa  915    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  50.4 
 
 		 1125 aa  994    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  48.29 
 
 		 1124 aa  877    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.74 
 
 		 1156 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  37.9 
 
 		 1157 aa  595  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  36.72 
 
 		 1162 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  36.55 
 
 		 1156 aa  562  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  37.13 
 
 		 1164 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.08 
 
 		 1183 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  35.54 
 
 		 1202 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 		 1187 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  35.09 
 
 		 1180 aa  535  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  34.81 
 
 		 1180 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  35.47 
 
 		 1180 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  35.93 
 
 		 1183 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  35.7 
 
 		 1185 aa  505  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  35.03 
 
 		 1183 aa  506  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  32.97 
 
 		 1155 aa  505  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  36.7 
 
 		 1166 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  37.27 
 
 		 1165 aa  493  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  34.07 
 
 		 1182 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  36.17 
 
 		 1157 aa  476  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  36.64 
 
 		 1147 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  39.49 
 
 		 1161 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  37.44 
 
 		 1157 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  34.8 
 
 		 1161 aa  466  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  37.4 
 
 		 1159 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  38.4 
 
 		 1161 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  37.08 
 
 		 1164 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  38.68 
 
 		 1157 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  27.84 
 
 		 1089 aa  399  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  39.97 
 
 		 1142 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  36.14 
 
 		 1151 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  36.27 
 
 		 1177 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  38.23 
 
 		 1167 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  36.12 
 
 		 1189 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  33.22 
 
 		 1147 aa  325  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 854 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.33 
 
 		 860 aa  300  1e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.27 
 
 		 1185 aa  227  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.12 
 
 		 907 aa  183  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 1165 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 1087 aa  174  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1057 aa  170  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 1101 aa  164  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 1121 aa  163  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 1168 aa  160  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  24.81 
 
 		 1241 aa  159  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.24 
 
 		 1240 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.03 
 
 		 1241 aa  157  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.24 
 
 		 1241 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.24 
 
 		 1241 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.03 
 
 		 1241 aa  156  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.81 
 
 		 1241 aa  156  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.24 
 
 		 1241 aa  157  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.89 
 
 		 1241 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  56.46 
 
 		 1147 aa  155  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  56.46 
 
 		 1147 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 1173 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 1101 aa  154  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.05 
 
 		 1242 aa  154  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 1173 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1177 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 1110 aa  149  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  26.28 
 
 		 1140 aa  149  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.89 
 
 		 1089 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.43 
 
 		 1226 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  23.7 
 
 		 1270 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 		 1117 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 1182 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  25.07 
 
 		 1248 aa  135  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  31.77 
 
 		 1107 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 1047 aa  134  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.06 
 
 		 1080 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1061 aa  134  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.88 
 
 		 1230 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 1149 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.79 
 
 		 1129 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.29 
 
 		 1197 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.88 
 
 		 1271 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.15 
 
 		 1218 aa  130  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.14 
 
 		 1086 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 1146 aa  129  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 1131 aa  127  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 1123 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  22.68 
 
 		 1392 aa  127  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 1095 aa  126  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 1162 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 1103 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  27.42 
 
 		 1187 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.65 
 
 		 1244 aa  121  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  25.32 
 
 		 915 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.55 
 
 		 1217 aa  119  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.65 
 
 		 1217 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.65 
 
 		 1217 aa  118  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>