More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2654 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  77 
 
 
400 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  83.75 
 
 
400 aa  697    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  100 
 
 
400 aa  830    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  77.25 
 
 
400 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  75.75 
 
 
400 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  75.75 
 
 
400 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  71.43 
 
 
400 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  71.68 
 
 
400 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  70.43 
 
 
400 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  70.93 
 
 
400 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  70.93 
 
 
401 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  70.43 
 
 
400 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  70.18 
 
 
400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  70.93 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  70.18 
 
 
400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  70.43 
 
 
400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  70.43 
 
 
401 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  69.67 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  69.1 
 
 
400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  68.84 
 
 
400 aa  568  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  68.84 
 
 
400 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  67.5 
 
 
400 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  68.59 
 
 
400 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  67.42 
 
 
400 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  65 
 
 
400 aa  544  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2107  aspartate aminotransferase  65.41 
 
 
400 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  64.5 
 
 
400 aa  534  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  64.16 
 
 
400 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  63.91 
 
 
400 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  63.91 
 
 
400 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0979  aspartate aminotransferase  63.41 
 
 
400 aa  525  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  63.91 
 
 
400 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  63.41 
 
 
400 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  63.16 
 
 
400 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2149  aminotransferase  64.56 
 
 
401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.286758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  61.65 
 
 
400 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  61.96 
 
 
404 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  61.71 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  62.22 
 
 
402 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  61.15 
 
 
400 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0172  aminotransferase, class I and II  61.9 
 
 
403 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  59.65 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1056  aspartate aminotransferase A  58.9 
 
 
400 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3420  aminotransferase, class I and II  58.94 
 
 
408 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  57.11 
 
 
410 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  57.14 
 
 
409 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  60.4 
 
 
400 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  56.39 
 
 
401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  53.25 
 
 
398 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 
409 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  54.39 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3626  aminotransferase  55.36 
 
 
411 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  53.73 
 
 
402 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 
406 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  54.4 
 
 
413 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  53.54 
 
 
404 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  53.79 
 
 
399 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  55.44 
 
 
394 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  56.67 
 
 
394 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1029  aspartate aminotransferase  54.89 
 
 
397 aa  430  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  53.92 
 
 
400 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  55.27 
 
 
392 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5800  aminotransferase class I and II  54.34 
 
 
402 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799353  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  54.87 
 
 
394 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  53.54 
 
 
399 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2925  aspartate aminotransferase  54.36 
 
 
402 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133142  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  52.26 
 
 
404 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6368  aspartate aminotransferase  53.38 
 
 
400 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  55.33 
 
 
392 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  55.38 
 
 
397 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3888  aminotransferase  56.03 
 
 
406 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  55.08 
 
 
392 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  55.38 
 
 
393 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  54.29 
 
 
398 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  55.9 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  53.83 
 
 
395 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4551  aspartate aminotransferase  53.38 
 
 
402 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146004  normal  0.171022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6360  aspartate aminotransferase  54.1 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70732  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0943  aspartate aminotransferase  51.79 
 
 
402 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.801255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  53.03 
 
 
397 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  55.24 
 
 
393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  49.5 
 
 
402 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
397 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0890  aminotransferase class I and II  49.36 
 
 
402 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0460  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
402 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2591  aspartate aminotransferase  48.23 
 
 
400 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0353  aminotransferase class I and II  51.79 
 
 
391 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.818092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
423 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  49.61 
 
 
394 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  50.64 
 
 
393 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  50.64 
 
 
393 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  47.22 
 
 
397 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  48.1 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  48.1 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  48.1 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  48.1 
 
 
395 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  47.85 
 
 
395 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 
397 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>