More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6404 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  40.62 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  44.29 
 
 		 146 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1607  ribonuclease H  42.36 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0543  ribonuclease H  45.07 
 
 		 146 aa  101  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.751982 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0581  ribonuclease H  42.55 
 
 		 146 aa  101  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0600  ribonuclease H  41.13 
 
 		 146 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.42246  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  44.29 
 
 		 153 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  40.15 
 
 		 159 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  38.64 
 
 		 269 aa  98.2  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0628  ribonuclease H  40.28 
 
 		 146 aa  98.2  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.702855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  45.59 
 
 		 143 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  40.4 
 
 		 145 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  42.75 
 
 		 149 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  42.22 
 
 		 159 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1098  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26429 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1744  ribonuclease H  39.6 
 
 		 146 aa  94.7  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1754  ribonuclease H  38.62 
 
 		 145 aa  94.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  41.38 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  40.94 
 
 		 148 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2851  ribonuclease H  41.73 
 
 		 147 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  41.96 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  36.3 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0673  ribonuclease H  37.24 
 
 		 147 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  41.91 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  40.94 
 
 		 147 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  45.07 
 
 		 153 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  38.93 
 
 		 153 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  39.73 
 
 		 156 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  41.13 
 
 		 149 aa  92.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  34.25 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  39.04 
 
 		 156 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  40.69 
 
 		 147 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  43.48 
 
 		 154 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1764  ribonuclease H  43.48 
 
 		 148 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  40.56 
 
 		 150 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  40.69 
 
 		 147 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  40.69 
 
 		 147 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  38.62 
 
 		 158 aa  91.7  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  38.93 
 
 		 148 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  38.93 
 
 		 148 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  42.66 
 
 		 152 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  39.29 
 
 		 157 aa  91.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  40.28 
 
 		 154 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  41.61 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  41.61 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  41.01 
 
 		 158 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  41.61 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2453  ribonuclease H  42.75 
 
 		 148 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  41.67 
 
 		 148 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  40.43 
 
 		 161 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  40 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  41.61 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  41.38 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  41.61 
 
 		 155 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  38.89 
 
 		 153 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  40.71 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  41.26 
 
 		 158 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  41.3 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0484  ribonuclease H  39.19 
 
 		 157 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  40 
 
 		 148 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  40.43 
 
 		 152 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  42.07 
 
 		 157 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  40.97 
 
 		 155 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  43.66 
 
 		 146 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  40 
 
 		 147 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  40 
 
 		 147 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  43.06 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  43.88 
 
 		 154 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  43.17 
 
 		 154 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  42.14 
 
 		 148 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  36.55 
 
 		 160 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  38.46 
 
 		 157 aa  88.6  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  42.34 
 
 		 155 aa  88.2  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  40 
 
 		 154 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  41.55 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  40.56 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  36.81 
 
 		 156 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  41.55 
 
 		 151 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  39.86 
 
 		 158 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  36.05 
 
 		 155 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  42.14 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  40.56 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  43.07 
 
 		 146 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  40.15 
 
 		 155 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  40.56 
 
 		 156 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0619  ribonuclease H  36.3 
 
 		 152 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.772003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>