More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0896 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0896  NusB antitermination factor  100 
 
 		 155 aa  300  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.361769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0803  NusB antitermination factor  50 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  50 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1680  NusB antitermination factor  53.68 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.429573  normal  0.936323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  48.82 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4049  NusB antitermination factor  48.85 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3853  transcription antitermination protein NusB  44.9 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0379  NusB antitermination factor  47.65 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.442506  normal  0.110028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11450  transcription antitermination protein NusB  46.43 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0546593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1049  transcription antitermination protein NusB  46.43 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1563  NusB antitermination factor  49.63 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06760  transcription antitermination protein NusB  51.18 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  46.46 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  46.46 
 
 		 134 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  46.46 
 
 		 134 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  46.46 
 
 		 134 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  45.67 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  45.67 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  45.67 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  45.67 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  45.67 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0846  NusB antitermination factor  45.6 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.423141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0584  transcription antitermination protein NusB  47.1 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  42.52 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  42.52 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  47.11 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  48.76 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  48.76 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  48.76 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  43.2 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0012  NusB antitermination factor  47.14 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  43.48 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0694  N utilization substance protein B  43.61 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  43.61 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  121  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0571  transcription antitermination protein NusB  46.1 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0518  transcription antitermination protein NusB  46.81 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.360149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0564  transcription antitermination protein NusB  46.81 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5015  transcription antitermination protein NusB  45.07 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  44.93 
 
 		 196 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0553  transcription antitermination protein NusB  46.81 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  48.06 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  41.6 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0579  transcription antitermination protein NusB  43.18 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  49.15 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  43.2 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1578  transcription antitermination protein NusB  43.18 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  42.42 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1315  transcription antitermination protein NusB  44.19 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  42.4 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  45.16 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0457  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0478  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0459  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0520  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0465  transcription antitermination protein NusB  46.28 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  43.8 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2919  transcription antitermination protein NusB  40.69 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1857  transcription antitermination protein NusB  38.46 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0201856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00364  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.997296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3193  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0337  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.570636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004261  transcription termination protein NusB  38.82 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00012061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3217  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0452  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00368  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0498  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2887  transcription antitermination protein NusB  42.34 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0447  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0487  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0884  transcription antitermination protein NusB  45.45 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2582  NusB antitermination factor  41.61 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  47.46 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01170  transcription antitermination protein NusB  38.82 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04396  transcription antitermination protein NusB  45.31 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0793  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0764  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2442  transcription antitermination protein NusB  41.84 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4056  transcription antitermination protein NusB  41.13 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3454  transcription antitermination protein NusB  42.86 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4793  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00602404  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1904  transcription antitermination protein NusB  44.35 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1844  transcription antitermination protein NusB  44.35 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2018  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.415369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2147  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3018  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1529  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0762  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3071  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2595  transcription antitermination protein NusB  40.28 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.694144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0476  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0955  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0917  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2192  NusB antitermination factor  42.18 
 
 		 145 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133717  hitchhiker  0.00000478528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0825  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.61519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0617  transcription antitermination protein NusB  38.57 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0816  transcription antitermination protein NusB  40.43 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0891  transcription antitermination protein NusB  40.31 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01422  transcription antitermination protein NusB  38.97 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2949  putative N utilization substance B (transcriptional antiterminator)(l factor) transcription regulator protein  41.73 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0215714  normal  0.679793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>