More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1308 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
381 aa  775    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.16 
 
 
391 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  31.55 
 
 
365 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
725 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
372 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  30.75 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  29.76 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
372 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
372 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  29.44 
 
 
372 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
396 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  28.69 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
508 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
456 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  37.45 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.57 
 
 
646 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  40 
 
 
413 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
742 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
517 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.82 
 
 
381 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
468 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  36.32 
 
 
309 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
779 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  37.11 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  38.43 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.61 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  40.1 
 
 
362 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
652 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.16 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  37.56 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
665 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.48 
 
 
387 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
655 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  40.1 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.85 
 
 
422 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
581 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.27 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33.66 
 
 
223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  36.87 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  33.49 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  38.5 
 
 
2361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  37.93 
 
 
393 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
402 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  36.24 
 
 
403 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
412 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.67 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  35.57 
 
 
282 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  35.16 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  39.77 
 
 
523 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
451 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  39.53 
 
 
516 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  33.91 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4674  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
651 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681088  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  33.68 
 
 
384 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3597  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
651 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.495482  normal  0.378972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
546 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
402 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
415 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33.33 
 
 
1033 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  35.94 
 
 
497 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  39.18 
 
 
523 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0979  putative transmembrane nitrate/nitrite sensor kinase transcription regulator protein  28.75 
 
 
637 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.82 
 
 
1048 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  39.8 
 
 
403 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
393 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  38.6 
 
 
523 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  38.6 
 
 
523 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
682 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
523 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  38.6 
 
 
523 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  34.7 
 
 
405 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5265  cGMP-specific and -stimulated phosphodiesterase/adenylate cyclase  38.6 
 
 
324 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  33.19 
 
 
373 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  28.21 
 
 
671 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
401 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
795 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
700 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  38.01 
 
 
523 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  33.17 
 
 
391 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
682 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6191  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
627 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0297171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
799 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
410 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.6 
 
 
462 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
545 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
469 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.97 
 
 
422 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  30.28 
 
 
395 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
372 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>