More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0487 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  785    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  60.98 
 
 		 389 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.29 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  55.15 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.85 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  55.41 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.43 
 
 		 385 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.99 
 
 		 392 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.31 
 
 		 389 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  54.69 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  53.25 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.48 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.22 
 
 		 391 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  52.86 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  53.16 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.82 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.44 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  52.85 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  52.49 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.44 
 
 		 390 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.12 
 
 		 392 aa  401  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  49.08 
 
 		 402 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  48.06 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.7 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 386 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  45.91 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45.65 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  46.17 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  45.65 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  45.38 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.55 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  46.74 
 
 		 387 aa  348  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.19 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  43.75 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  46.07 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  45.27 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  44.59 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  43.41 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  43.41 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  43.67 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  43.31 
 
 		 405 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  45.66 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  42.78 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  42.78 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.78 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  43.04 
 
 		 405 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  42.16 
 
 		 425 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  41.97 
 
 		 392 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  43.08 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  41.45 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  41.45 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  40.93 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  40.87 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  42.33 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  42.64 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  39.37 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.45 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  41.9 
 
 		 413 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0516  aminotransferase, class I and II  41.91 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  40.31 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  41.16 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  39.84 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.18 
 
 		 395 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  41.21 
 
 		 406 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  40.42 
 
 		 406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  39.01 
 
 		 406 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  38.7 
 
 		 399 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  41.22 
 
 		 425 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  41.05 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  41.05 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  39.37 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  37.92 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0957  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000423208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  39.53 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  40.31 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  39.9 
 
 		 406 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  38.74 
 
 		 406 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  38.44 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  40.2 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  39.27 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  39.27 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  37.66 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  39.11 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  37.89 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  40.79 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  39.9 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  39.37 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>