More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0406 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 154 aa  320  5e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  73.29 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.94 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.41 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  57.38 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  57.02 
 
 		 291 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.02 
 
 		 291 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  54.84 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  55.65 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  57.26 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  54.84 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.02 
 
 		 309 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.66 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.1 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  54.47 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.74 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.47 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.2 
 
 		 286 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.28 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.24 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  56.1 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 298 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.57 
 
 		 329 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  47.92 
 
 		 312 aa  143  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.3 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.23 
 
 		 277 aa  142  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 		 284 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 		 284 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  49.29 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  50.76 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  53.6 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.55 
 
 		 344 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.89 
 
 		 283 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.59 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  53.39 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.13 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.13 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  52.03 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  48.06 
 
 		 211 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.38 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.62 
 
 		 284 aa  136  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  47.83 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.79 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  52.07 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.07 
 
 		 278 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.18 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.41 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.95 
 
 		 280 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.53 
 
 		 277 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.61 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  49.24 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  50.37 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  50 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  50.37 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  50.37 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  54.92 
 
 		 125 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  49.61 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  50.39 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.76 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.59 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.38 
 
 		 200 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  50.77 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  50.77 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.18 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.92 
 
 		 281 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.79 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  50 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  50.77 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  48.89 
 
 		 133 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.58 
 
 		 281 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.06 
 
 		 300 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.29 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  50 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  49.22 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  50.4 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.89 
 
 		 281 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.38 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  47.66 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  47.41 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.37 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.89 
 
 		 290 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.66 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  50.78 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  47.66 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  47.24 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.66 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  49.22 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.03 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.22 
 
 		 276 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>