251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0152 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  100 
 
 		 416 aa  867    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1450  Fic family protein  27.25 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3019  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.3 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.52 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  28.12 
 
 		 328 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.86 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.78 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.88 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  30.61 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.2 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4037  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.82 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.11 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.72 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2528  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.02 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  29.17 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.57 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.57 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.81 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.4 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.28 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.4 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  30.53 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.99 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.98 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  27.62 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1912  putative MloA protein  34.88 
 
 		 356 aa  67  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.56 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.51 
 
 		 359 aa  67  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0300  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.57 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.59 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  31.85 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.15 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  28.32 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.86 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  30.39 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.94 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.58 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  28.91 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.33 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  25.12 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  26.14 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  28.91 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  26 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  25.93 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.85 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.97 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.28 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.79 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1532  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.61 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  33.77 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  46.48 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.53 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03956  Fic protein family  35.64 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  33.82 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  27.04 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  24 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.76 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0623  hypothetical protein  23.6 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.8 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  29.58 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  43.08 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.08 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.93 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3599  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.2 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1403  MloA  27.81 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.10524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.77 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.29 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0373  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.54 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.5223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.78 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.9 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.89 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  45 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0297  hypothetical protein  44.93 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  25.49 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.16 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.54 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.15 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.49 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.37 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.3 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>