More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0086 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  80.66 
 
 		 244 aa  387  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  52.42 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  49.59 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  50.42 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  50.42 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  47.21 
 
 		 282 aa  231  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  47.57 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  43.53 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  47.7 
 
 		 275 aa  214  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  48.32 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  45.61 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  44.58 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  46.03 
 
 		 272 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  45.83 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  46.03 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  44.54 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  43.59 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  46.03 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  43.16 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  45.73 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  44.4 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  45.19 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  43.44 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  44.35 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  43.44 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  43.51 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  44.35 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  43.44 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  43.93 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  43.93 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  43.93 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  43.93 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  38.11 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  43.86 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  45.62 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  43.86 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  43.1 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  41.98 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  41.67 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  42.98 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  42.54 
 
 		 238 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  46.05 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  46.05 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  45.13 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  42.98 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  44.54 
 
 		 233 aa  178  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  44.19 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  44.19 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  44.19 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  44.65 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  43.83 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  40.42 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  44.5 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  42.02 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  43.38 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  43.04 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  39.91 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  41.7 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  41.3 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  40.98 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  40.87 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  40.79 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  42.86 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  40.52 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  39.92 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  39.47 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  38.02 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  39.06 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  39.11 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  41.56 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  38.36 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  38.78 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  38.98 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  41.42 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  39.83 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  38.24 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  34.54 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  36.76 
 
 		 274 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  38.25 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  35.93 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  36.48 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  35.86 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  34.44 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  32.81 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  34.04 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  34.13 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  32.77 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  33.97 
 
 		 338 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  32.17 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  34.88 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  33.91 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  35.57 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  33.06 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>