277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4218 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  100 
 
 		 322 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  60.39 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  45.26 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  48.11 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  46.8 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  44.63 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  46.96 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  46.62 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  46.28 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  47.08 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  48.56 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  46.74 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  47.48 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  45.16 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  46.98 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  43.39 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  40.91 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  44.31 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  47.54 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  46.04 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  43.37 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  43.73 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  47.54 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  45.99 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  45.58 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  44.09 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  44.76 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  45.45 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  44.41 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  42.5 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  44.41 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  44.06 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.55 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  45.09 
 
 		 282 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  45.09 
 
 		 282 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  45.09 
 
 		 282 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  43.2 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  44.37 
 
 		 301 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  41.98 
 
 		 305 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  43.36 
 
 		 283 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2528  taurine dioxygenase  45.74 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2536  taurine dioxygenase  45.74 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189114  normal  0.626822 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  45.82 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2491  taurine dioxygenase  45.74 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  40.58 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  43 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  41.56 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  38.1 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0272  hypothetical protein  42.86 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18160  Probable taurine catabolism dioxygenase  43.25 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  41.43 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  42.11 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  40.71 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02420  hypothetical protein  43.36 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  41.07 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  41.07 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  41.07 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  41.07 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.67 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  41.07 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  42.7 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  41.81 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  39.93 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  44.4 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  39 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2982  Taurine dioxygenase  40.54 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  43.66 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  42.81 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  43.17 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5003  taurine dioxygenase  42.42 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  40 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2229  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  41.18 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  43.62 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  41.11 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  38.65 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  41.7 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  38.81 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  39.47 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0686  Taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0353527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  40.33 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  42.22 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  40.71 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  38.51 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  39.43 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  37.37 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.25 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  39.3 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  38.85 
 
 		 264 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  38.21 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3036  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.163614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  38.46 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  37.87 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  37.87 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>