More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3592 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  100 
 
 
251 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  59.07 
 
 
241 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  59.83 
 
 
241 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  60.59 
 
 
237 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  60.49 
 
 
243 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  57.61 
 
 
243 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  60.08 
 
 
237 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  56.96 
 
 
255 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  61.64 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  57.38 
 
 
237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  58.44 
 
 
243 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  58.44 
 
 
243 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  58.44 
 
 
243 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  58.58 
 
 
239 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  52.7 
 
 
241 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  52.63 
 
 
249 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  48.74 
 
 
238 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  46.84 
 
 
240 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  48.32 
 
 
238 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  50.63 
 
 
240 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  45.64 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 
222 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
710 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
711 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  30.09 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  40.17 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  28.51 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  42.52 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  27.11 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  29.46 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.92 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  31.03 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.39 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.62 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  37.7 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  30.2 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.1 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  39.82 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.83 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.22 
 
 
345 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 
634 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.31 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.34 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  40.19 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.86 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  36.44 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.33 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  38.66 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  38.84 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  40.35 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.46 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.86 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  30.41 
 
 
343 aa  62.4  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  34.74 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  39.32 
 
 
1014 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.86 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.26 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  40 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.61 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  34.11 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.28 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
417 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>