More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2208 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
403 aa  778    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  36.63 
 
 
401 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
415 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 
445 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
403 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
403 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
409 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27.74 
 
 
401 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
394 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  39.11 
 
 
391 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
426 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  31.75 
 
 
384 aa  189  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
391 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
405 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
404 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
414 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
410 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
401 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
398 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
387 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
539 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  38.59 
 
 
413 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
402 aa  149  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
405 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
418 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.55 
 
 
778 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5224  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
353 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
425 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  29.45 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  27.49 
 
 
403 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
403 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 
397 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
384 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
452 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
424 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
395 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.92 
 
 
350 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
904 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
423 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
373 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 
412 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
440 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
441 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
423 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
428 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
424 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
398 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1095  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174275  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
440 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1203  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359152  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  41.52 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
447 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  31.67 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
373 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
782 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
375 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
386 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
466 aa  93.2  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
420 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
360 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
396 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
396 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
396 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  38.91 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
385 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
366 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
367 aa  90.1  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>