More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0526 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  51.25 
 
 		 652 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  51.25 
 
 		 652 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 		 652 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  65.41 
 
 		 653 aa  846    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.41 
 
 		 644 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.63 
 
 		 662 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 660 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  51.25 
 
 		 652 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  50.89 
 
 		 657 aa  641    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  51.25 
 
 		 652 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  50.31 
 
 		 657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.96 
 
 		 658 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.82 
 
 		 663 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  52.8 
 
 		 655 aa  687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  52.71 
 
 		 654 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  71.67 
 
 		 656 aa  945    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.4 
 
 		 658 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  51.38 
 
 		 660 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.68 
 
 		 655 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  50.57 
 
 		 652 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.52 
 
 		 657 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 		 660 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.05 
 
 		 657 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  52.9 
 
 		 651 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  70.4 
 
 		 661 aa  946    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  51.55 
 
 		 660 aa  679    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00711  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase) (Acyl-activating enzyme)  51.78 
 
 		 648 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.11 
 
 		 667 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  54.92 
 
 		 673 aa  710    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  53.35 
 
 		 666 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.23 
 
 		 657 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  51.62 
 
 		 638 aa  659    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.33 
 
 		 653 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  61.23 
 
 		 656 aa  787    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  52.4 
 
 		 660 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  57.16 
 
 		 656 aa  749    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  54.29 
 
 		 646 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  66.51 
 
 		 654 aa  862    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  50.63 
 
 		 631 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  57.33 
 
 		 667 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 		 652 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 660 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  50.38 
 
 		 664 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  51.25 
 
 		 652 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 		 644 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  53.21 
 
 		 664 aa  698    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2494  acetyl-CoA synthetase  53.04 
 
 		 649 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 654 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0209  acetyl-CoA synthetase  53.91 
 
 		 650 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1068  acetate--CoA ligase  57.12 
 
 		 673 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 		 660 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 		 644 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  53.51 
 
 		 649 aa  724    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.91 
 
 		 650 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  53.59 
 
 		 649 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  50.62 
 
 		 650 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.62 
 
 		 658 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  50.38 
 
 		 660 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  56.81 
 
 		 652 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.38 
 
 		 655 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.24 
 
 		 658 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.99 
 
 		 656 aa  712    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5574  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 		 652 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  66.09 
 
 		 660 aa  875    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  58.06 
 
 		 644 aa  731    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.16 
 
 		 660 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 		 652 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  56.1 
 
 		 655 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  66.09 
 
 		 666 aa  875    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  71.17 
 
 		 715 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  52.73 
 
 		 645 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  51.82 
 
 		 660 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  51.05 
 
 		 657 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 660 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 		 652 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0731  acetyl-CoA synthetase  51.88 
 
 		 644 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40572  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  51.42 
 
 		 631 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  52.75 
 
 		 670 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  64.21 
 
 		 673 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  64.02 
 
 		 676 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  55.24 
 
 		 649 aa  699    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.4 
 
 		 664 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  52.21 
 
 		 658 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.16 
 
 		 670 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  55.96 
 
 		 660 aa  728    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  51.64 
 
 		 667 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 650 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  52.61 
 
 		 650 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.1 
 
 		 644 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.17 
 
 		 660 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  69.5 
 
 		 657 aa  929    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  53.18 
 
 		 667 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  53.04 
 
 		 657 aa  690    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  71.21 
 
 		 664 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  65.02 
 
 		 651 aa  840    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.4 
 
 		 645 aa  643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  66.09 
 
 		 660 aa  875    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  53.06 
 
 		 653 aa  643    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5425  acetyl-CoA synthetase  65.57 
 
 		 663 aa  863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  51.02 
 
 		 632 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>