More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2342 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  55.97 
 
 
280 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
274 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 
785 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 
1162 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
1268 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
369 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
1523 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
1523 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.43 
 
 
2401 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
1435 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
457 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.8 
 
 
1119 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 
525 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
1739 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
1340 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
1077 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
616 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
679 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
624 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.22 
 
 
700 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
318 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0721  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315795  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
703 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
722 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
346 aa  89  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.03 
 
 
320 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
994 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
1359 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
1600 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
1267 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
291 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
337 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
314 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2203  hypothetical protein  26.94 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3563  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.03489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  28.52 
 
 
723 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  28.51 
 
 
1444 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
1509 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
1267 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
410 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
841 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
1312 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
557 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2201  putative signal peptide protein  25.81 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
1256 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.61 
 
 
860 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
680 aa  79.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
411 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
353 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
632 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
582 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
902 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
746 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
1106 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
602 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.15 
 
 
1644 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.15 
 
 
1644 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
625 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.34 
 
 
1225 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.22 
 
 
358 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
1314 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
880 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
988 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.29 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.92 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>