More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0721 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0721  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315795  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  49.15 
 
 
294 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
318 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0419  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1239  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.769804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4831  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
294 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2753  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
297 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
722 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2725  putative glucosyltransferase  29.01 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
1268 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  31.17 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
1267 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
1162 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
785 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  26.41 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1523 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1523 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.82 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  22.27 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
841 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
703 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
624 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.12 
 
 
700 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
1267 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25 
 
 
2401 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  22.3 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
836 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
525 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
679 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.55 
 
 
860 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
337 aa  62.4  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
1188 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
994 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  24.03 
 
 
1435 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
581 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  25.45 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.37 
 
 
754 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
324 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  20.43 
 
 
342 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  23.77 
 
 
652 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
729 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
324 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>