More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3563 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3563  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.03489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30 
 
 
700 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
785 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  26.09 
 
 
1444 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
544 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
1162 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
994 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
324 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 
369 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
333 aa  58.9  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
1359 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  22.52 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.52 
 
 
1099 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
1435 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
756 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
679 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 
401 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
1600 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.36 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
1312 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.99 
 
 
317 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
1268 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
1301 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  30.93 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  20.63 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  28.41 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.47 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  23.57 
 
 
349 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  21.74 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  21 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 
1077 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.18 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  30.61 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  29.21 
 
 
344 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
310 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
785 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  23.26 
 
 
1119 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  31.19 
 
 
344 aa  52.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
322 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
353 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  21.2 
 
 
703 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
672 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  28.09 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
305 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
334 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 
624 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  28.09 
 
 
344 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
1314 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.72 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  32.18 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
680 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
470 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
704 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
319 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26500  glycosyl transferase  31.97 
 
 
632 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
1032 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  28 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.09 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
752 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  22.1 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.58 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
303 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  25.93 
 
 
391 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  32.73 
 
 
470 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  20.92 
 
 
2401 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
729 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  26.74 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  25.84 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>