More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1960 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 328 aa  685    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.71 
 
 		 327 aa  569  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.74 
 
 		 327 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  78.05 
 
 		 327 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  77.13 
 
 		 327 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  68 
 
 		 326 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 329 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 329 aa  361  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 405 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 373 aa  328  9e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 340 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 354 aa  308  8e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 403 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 403 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  43.87 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.79 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.9 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 400 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.64 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.16 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 400 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 		 400 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.82 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.09 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.18 
 
 		 346 aa  235  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>