38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4271 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.17 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  27.46 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  48.94 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  25.15 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 428 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>