More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2876 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  66.01 
 
 		 276 aa  342  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  63.7 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  64.53 
 
 		 268 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  62.6 
 
 		 282 aa  326  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 		 304 aa  300  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  59.84 
 
 		 262 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  58.69 
 
 		 362 aa  298  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  57.98 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.65 
 
 		 265 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  57.36 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  57.03 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  57.83 
 
 		 269 aa  285  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  58 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  54.24 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  55.64 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  51.46 
 
 		 274 aa  271  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  54.79 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  52.54 
 
 		 293 aa  268  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  53.94 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  55.64 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  48.25 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.64 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.96 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  25.55 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.83 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.41 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  33.33 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  33.33 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  25 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.37 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  25.32 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  24.5 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  24.5 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.25 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.69 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.21 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.12 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.42 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.96 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.21 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.32 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.21 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  39.6 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.21 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  34.58 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.65 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.54 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  28.79 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.21 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  20.8 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.99 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.19 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>