More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2822 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  60.29 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  57.56 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  57.07 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  56.65 
 
 		 211 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  53.47 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  49.04 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  51.76 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  51.31 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  47.96 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  49.5 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  48.47 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 188 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 184 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  46.28 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 		 182 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  45.21 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  40.98 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  37.2 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  33.54 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  36.42 
 
 		 176 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  44.89 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 176 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  35.86 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  32.52 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  33.13 
 
 		 176 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  35.86 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 189 aa  99.4  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  40.16 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 187 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 163 aa  94.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  35.03 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>