81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2413 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 141 aa  271  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  54.41 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  47.62 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  46.04 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  51.08 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  47.48 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  47.48 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  47.48 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  45.58 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  43.7 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  44.85 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  43.28 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  52.94 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  47.06 
 
 		 181 aa  93.2  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  46.85 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  49.26 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  44.12 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  44.72 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  38.93 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  46.48 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  47.06 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  47.79 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  46.15 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  46.76 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  41.22 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  47.13 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  38.24 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  41.3 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  45.99 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  34.53 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  26.47 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  42.39 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  39.42 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  36.57 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  37.14 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  33.82 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  29.77 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  35.88 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.22 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  34.06 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  41.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  32.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  25.18 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  28.26 
 
 		 458 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.66 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  29.85 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  42.36 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  29.32 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  37.08 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  30.43 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  27.46 
 
 		 455 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.1 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  33.58 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  27.01 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  32.58 
 
 		 455 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  32.95 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  36.76 
 
 		 430 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  29.1 
 
 		 153 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>