More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1111 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  100 
 
 
299 aa  590  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  73.9 
 
 
276 aa  343  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  67.73 
 
 
272 aa  342  5e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  75.44 
 
 
270 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  75.44 
 
 
270 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  73.33 
 
 
266 aa  319  4e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  74.53 
 
 
238 aa  318  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  77.62 
 
 
271 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  71.36 
 
 
267 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  68.63 
 
 
266 aa  314  1e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  58.89 
 
 
272 aa  301  7e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  61.73 
 
 
273 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  56.46 
 
 
306 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  65.71 
 
 
266 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  60.33 
 
 
238 aa  285  6e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  62.2 
 
 
250 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  61.06 
 
 
280 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  57.31 
 
 
242 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  56.13 
 
 
242 aa  266  3e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  62.45 
 
 
228 aa  265  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  61.14 
 
 
296 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  56.47 
 
 
265 aa  262  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  61.54 
 
 
287 aa  259  5e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  60.38 
 
 
273 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  57.74 
 
 
246 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  56 
 
 
275 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  57.08 
 
 
269 aa  253  2e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  60.09 
 
 
273 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  55.3 
 
 
320 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  60.59 
 
 
277 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  60.29 
 
 
267 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  58.94 
 
 
255 aa  248  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  56.56 
 
 
301 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  57.87 
 
 
259 aa  238  7e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  56.52 
 
 
317 aa  234  1e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  57.99 
 
 
262 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  50 
 
 
243 aa  201  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  48.78 
 
 
298 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  7.07521e-10 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.64 
 
 
188 aa  189  3e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  51.04 
 
 
175 aa  189  6e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.72103e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  47.32 
 
 
297 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  49.52 
 
 
181 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  44.39 
 
 
194 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  49.48 
 
 
176 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  51.31 
 
 
175 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.47395e-09  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  47.12 
 
 
187 aa  184  2e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  43.72 
 
 
203 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  48.17 
 
 
175 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.2864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  47.92 
 
 
178 aa  182  5e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  2.31337e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  47.12 
 
 
176 aa  181  9e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 
178 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  1.9364e-08 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  45.32 
 
 
194 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  47.18 
 
 
177 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  46.88 
 
 
177 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.49 
 
 
185 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  46.35 
 
 
177 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  50.26 
 
 
176 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.96245e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  44.27 
 
 
181 aa  176  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.64949e-09  unclonable  2.28976e-08 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  46.35 
 
 
177 aa  175  7e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.69889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  49.21 
 
 
172 aa  174  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  47.64 
 
 
177 aa  174  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.63 
 
 
174 aa  173  3e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.27534e-14  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  46.6 
 
 
201 aa  173  4e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  44.33 
 
 
182 aa  172  6e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  49.75 
 
 
177 aa  172  6e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.31665e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  46.6 
 
 
173 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.96375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.09778e-09  unclonable  4.06083e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.6 
 
 
174 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.07525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  43.81 
 
 
178 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.76433e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.32326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.57799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 
177 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.61698e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  43.81 
 
 
182 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  43.81 
 
 
182 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  48.45 
 
 
177 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.81772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  48.47 
 
 
185 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.17 
 
 
175 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.00106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  43.59 
 
 
183 aa  163  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  43.23 
 
 
180 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.33893e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  43.98 
 
 
173 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.34964e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  43.98 
 
 
173 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  2.31541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  44.79 
 
 
180 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  41.88 
 
 
178 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  46.32 
 
 
177 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  46.07 
 
 
175 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.33733e-06  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  41.36 
 
 
199 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  42.41 
 
 
174 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.37782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 
185 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  42.11 
 
 
172 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.3421e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
178 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  43.14 
 
 
198 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.49386e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.75 
 
 
177 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 
176 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  42.41 
 
 
176 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  44.21 
 
 
175 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>