More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0622 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 543 aa  1090    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  96.32 
 
 		 544 aa  1032    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  56.78 
 
 		 544 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  48.17 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  44.04 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 770 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.07 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 607 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 598 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  34.08 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  35.3 
 
 		 679 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 603 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 604 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 919 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 679 aa  309  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  34.58 
 
 		 742 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  30.94 
 
 		 774 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 673 aa  306  8.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  30.96 
 
 		 769 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  31.4 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 		 919 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  30.79 
 
 		 769 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 954 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 741 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 728 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  40.66 
 
 		 1089 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4452  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 680 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 1031 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4471  CheA signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 684 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4316  CheA signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 674 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 920 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0031  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  33.33 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 871 aa  294  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  33.22 
 
 		 766 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 681 aa  293  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 558 aa  291  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 671 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 742 aa  290  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 1030 aa  290  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 957 aa  288  1e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 671 aa  289  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 662 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 760 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  37.16 
 
 		 598 aa  286  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 686 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  31.43 
 
 		 639 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  29.59 
 
 		 801 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 675 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.52 
 
 		 677 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  37.06 
 
 		 685 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.1 
 
 		 734 aa  279  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 697 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 695 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 729 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 878 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 713 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 655 aa  274  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 730 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.12 
 
 		 770 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 682 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 686 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  40.05 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 701 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 666 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  40.05 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 702 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  31.33 
 
 		 625 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 614 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 671 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 673 aa  269  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 657 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.92 
 
 		 770 aa  269  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 679 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  38.95 
 
 		 654 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  38.68 
 
 		 654 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 654 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.66 
 
 		 767 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  34.44 
 
 		 754 aa  267  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.92 
 
 		 785 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.23 
 
 		 783 aa  266  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 745 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 660 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 696 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 		 670 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 691 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  32.86 
 
 		 670 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 802 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 666 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  35.53 
 
 		 897 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.03 
 
 		 803 aa  261  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 719 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  37.99 
 
 		 1010 aa  260  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 701 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 792 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>