More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2742 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
541 aa  1114    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.72 
 
 
536 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  44.98 
 
 
536 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.54 
 
 
536 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  46.31 
 
 
533 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.54 
 
 
536 aa  498  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  44.98 
 
 
536 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  44.8 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  44.8 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 
536 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  43.6 
 
 
529 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  43.6 
 
 
529 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  42.08 
 
 
535 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  38.46 
 
 
538 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 
541 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  37.64 
 
 
552 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  37.45 
 
 
534 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  38.3 
 
 
535 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  39.42 
 
 
549 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  36.01 
 
 
535 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  38.18 
 
 
544 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  35.6 
 
 
534 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  37.13 
 
 
537 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  36.13 
 
 
530 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0756  extracellular solute-binding protein family 5  37.64 
 
 
549 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  36.95 
 
 
537 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  33.98 
 
 
530 aa  332  7.000000000000001e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  36.36 
 
 
537 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  36.35 
 
 
537 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  36.36 
 
 
537 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  36.55 
 
 
537 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  36.55 
 
 
537 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.76 
 
 
537 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 
549 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  37.12 
 
 
534 aa  329  7e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  34.59 
 
 
544 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 
538 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 
538 aa  326  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  36.97 
 
 
530 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  35.29 
 
 
547 aa  323  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 
533 aa  323  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  35.06 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1344  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.71 
 
 
548 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000429246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1306  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.71 
 
 
548 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.73 
 
 
543 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1935  4-phytase  34.03 
 
 
540 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4102  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.47 
 
 
548 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  36.24 
 
 
556 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  36.24 
 
 
556 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
561 aa  316  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3850  extracellular solute-binding protein family 5  34.74 
 
 
522 aa  316  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  316  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 
542 aa  316  9e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  38.52 
 
 
543 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1240  oligopeptide-binding protein OppA  35.34 
 
 
548 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1905  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.72 
 
 
542 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3475  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.46 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252761 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  33.08 
 
 
531 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  35.48 
 
 
547 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1954  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.27 
 
 
542 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0666582  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.98 
 
 
525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1709  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  33.97 
 
 
542 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.173972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1867  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.27 
 
 
542 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1089  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.15 
 
 
548 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.231521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1083  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  35.15 
 
 
548 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00147286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 
525 aa  312  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1683  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, oppA-like  33.52 
 
 
542 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1983  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.27 
 
 
542 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.776942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  35.73 
 
 
534 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1095  extracellular solute-binding protein  35.15 
 
 
548 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.152355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
545 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.38 
 
 
558 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  36.38 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.38 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  36.38 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.38 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.38 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  36.38 
 
 
558 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.38 
 
 
543 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  38.14 
 
 
552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.8 
 
 
525 aa  311  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  38.14 
 
 
552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  35.77 
 
 
543 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1732  oligopeptide ABC transporter solute binding protein  34.32 
 
 
519 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.19 
 
 
543 aa  310  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2896  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.62 
 
 
540 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1856  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  36.43 
 
 
553 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.882448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  35.12 
 
 
558 aa  309  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2576  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  34.62 
 
 
540 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.183921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2031  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.43 
 
 
553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>