More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3120 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  100 
 
 
627 aa  1296    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  40.35 
 
 
620 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  40.35 
 
 
620 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  40.13 
 
 
620 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  40.1 
 
 
615 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  37.5 
 
 
807 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.82 
 
 
891 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.6 
 
 
572 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.05 
 
 
567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.51 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.58 
 
 
575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.58 
 
 
575 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.58 
 
 
194 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.58 
 
 
575 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.46 
 
 
575 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.46 
 
 
575 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.35 
 
 
843 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  42.78 
 
 
578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  42.78 
 
 
579 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  42.7 
 
 
876 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.34 
 
 
596 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.22 
 
 
579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  42.22 
 
 
579 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.22 
 
 
397 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.22 
 
 
348 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.9 
 
 
575 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  45.57 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  37.08 
 
 
599 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.08 
 
 
599 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  43.83 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  44.3 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.5 
 
 
1016 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.51 
 
 
533 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.75 
 
 
539 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.99 
 
 
533 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  34.7 
 
 
758 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.16 
 
 
693 aa  105  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  39.61 
 
 
470 aa  102  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.87 
 
 
459 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  36.87 
 
 
459 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.87 
 
 
459 aa  100  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.31 
 
 
470 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  36.59 
 
 
573 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3089  S-layer protein  35.96 
 
 
338 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.706009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2982  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  36.17 
 
 
591 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.2 
 
 
470 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3033  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  36.17 
 
 
591 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3311  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
591 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  34.21 
 
 
935 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3295  S-layer protein, putative  35.83 
 
 
591 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.11 
 
 
526 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.4 
 
 
1174 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  31.43 
 
 
518 aa  91.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.59 
 
 
1226 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.76 
 
 
591 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.653459  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0787  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosamidase  38.19 
 
 
234 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  31.58 
 
 
932 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.86 
 
 
506 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.23 
 
 
792 aa  88.2  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  32.18 
 
 
1194 aa  87.4  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  32.93 
 
 
1821 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.95 
 
 
414 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  28.27 
 
 
920 aa  87.4  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  30.65 
 
 
288 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  29.95 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.81 
 
 
1042 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  33.33 
 
 
1223 aa  86.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 
1321 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  32.37 
 
 
921 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  28.33 
 
 
631 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  29.38 
 
 
820 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  29.49 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.62 
 
 
926 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  32.54 
 
 
506 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.32 
 
 
1009 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  30.98 
 
 
548 aa  84  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  32.52 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.98 
 
 
1029 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  33.14 
 
 
1081 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  30.59 
 
 
1208 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  26.87 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  32.04 
 
 
461 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  32.04 
 
 
461 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  33.9 
 
 
548 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  32.04 
 
 
461 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  32.04 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  27.22 
 
 
625 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  32.74 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.36 
 
 
1847 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.29 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  31.89 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  26.98 
 
 
1421 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.97 
 
 
629 aa  77.4  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.59 
 
 
1661 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30 
 
 
710 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  30.64 
 
 
669 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.4 
 
 
1328 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  35.33 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.03 
 
 
6885 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
995 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>