More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2960 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  79.05 
 
 		 253 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  75.5 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  74.3 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  73.49 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  73.49 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  73.49 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  73.9 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  73.49 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  73.09 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  73.09 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  73.09 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  73.09 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  62.99 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  61.42 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 252 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  57.03 
 
 		 251 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 249 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 		 252 aa  291  8e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  57.26 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  57.03 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56.18 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 646 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  58.68 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  56.45 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.47 
 
 		 650 aa  275  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  55.65 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  52.63 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  51.59 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  53.2 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  51.01 
 
 		 251 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  51.97 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 251 aa  248  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 655 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.45 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  51.06 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  51 
 
 		 298 aa  241  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  48.25 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.2 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  48.57 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  234  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1825  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10411  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  50.21 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 251 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  47.47 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0239  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000101955  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.62 
 
 		 654 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>