More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2791 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 314 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  67.89 
 
 		 328 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  53.97 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  53.97 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  50.16 
 
 		 316 aa  338  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  49.21 
 
 		 316 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  49.21 
 
 		 316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  48.26 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  47.63 
 
 		 316 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  47.95 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  47.63 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  47.63 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  47.63 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  47 
 
 		 316 aa  318  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  48.66 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  39.18 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.73 
 
 		 514 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  33.78 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.37 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  35.05 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  34.89 
 
 		 506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.85 
 
 		 515 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.85 
 
 		 515 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  30.51 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  31.45 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  31.7 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.75 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  30.89 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  30.89 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.11 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  29 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.53 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.16 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  30.23 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  31.93 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  29.3 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  31.98 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  28.06 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.71 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  30.29 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 		 285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  25.33 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.44 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  24.15 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  27.57 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  28.89 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.37 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.12 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.34 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.63 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  28.73 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  26 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  25.85 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  28.89 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  26.16 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  29.79 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  27.88 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.18 
 
 		 322 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.21 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  26.75 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  28 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  26.96 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>