109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2770 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  67.02 
 
 
195 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  64.74 
 
 
190 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  264  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  264  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  63.68 
 
 
190 aa  264  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  63.16 
 
 
190 aa  263  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  63.16 
 
 
190 aa  263  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  63.16 
 
 
190 aa  262  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  62.63 
 
 
190 aa  260  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  62.11 
 
 
190 aa  258  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  51.31 
 
 
187 aa  205  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  53.93 
 
 
187 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  53.93 
 
 
187 aa  205  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  47.7 
 
 
188 aa  171  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  46.02 
 
 
188 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  45.25 
 
 
190 aa  168  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  42.11 
 
 
187 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  45.11 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  40.68 
 
 
196 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  38.83 
 
 
193 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  42.11 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  39.25 
 
 
195 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  45.77 
 
 
194 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  42.6 
 
 
200 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  42.86 
 
 
243 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  35.98 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  40.7 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  40.12 
 
 
182 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  41.18 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  36.26 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  35.11 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  34.34 
 
 
211 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  33.51 
 
 
192 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  37.28 
 
 
1128 aa  121  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  38.38 
 
 
235 aa  121  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  38.27 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  31.4 
 
 
232 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  39.06 
 
 
201 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  31.95 
 
 
183 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  32.94 
 
 
181 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  31.36 
 
 
183 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  28.49 
 
 
194 aa  101  8e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  30.41 
 
 
225 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  26.32 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
190 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2707  Methyltransferase type 11  22.86 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.18 
 
 
313 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2496  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.53 
 
 
236 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  27.34 
 
 
475 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  36.51 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  36.51 
 
 
262 aa  45.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  28.09 
 
 
315 aa  45.4  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  28.09 
 
 
316 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2313  generic methyltransferase  37.5 
 
 
252 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0714275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0935  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.34 
 
 
298 aa  45.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  40 
 
 
280 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.46 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  28.57 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3463  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.21 
 
 
319 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1255  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.87 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00341421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.27 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152496  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  31.08 
 
 
421 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2862  S-adenosylmethionine-dependentmethyltransferase  34.94 
 
 
330 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.08 
 
 
421 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1399  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.14 
 
 
327 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.466335  normal  0.0101144 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.08 
 
 
421 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.34 
 
 
310 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.52 
 
 
291 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  31.03 
 
 
266 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  32.97 
 
 
314 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.73 
 
 
421 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
287 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.73 
 
 
419 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  29.73 
 
 
419 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.34 
 
 
316 aa  42.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  29.73 
 
 
421 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  29.73 
 
 
420 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  28.38 
 
 
419 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  24.34 
 
 
315 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  40 
 
 
278 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.69 
 
 
293 aa  42  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  30.77 
 
 
268 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
262 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3273  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.35 
 
 
266 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556001  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  38.33 
 
 
241 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
624 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.53 
 
 
348 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00956615  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  23.81 
 
 
315 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  28.38 
 
 
420 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  28.38 
 
 
420 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  28.38 
 
 
420 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  28.38 
 
 
420 aa  41.6  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  28.38 
 
 
420 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>