More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2591 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  69.03 
 
 		 477 aa  661    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1522  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1313  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 464 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1287  isopropylmalate isomerase large subunit  67.32 
 
 		 464 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  68.31 
 
 		 469 aa  661    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 464 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1125  isopropylmalate isomerase large subunit  67.46 
 
 		 464 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1493  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 464 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 470 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1455  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3889  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 471 aa  975    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  92.77 
 
 		 471 aa  909    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2225  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.81 
 
 		 471 aa  655    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.918253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1286  isopropylmalate isomerase large subunit  67.1 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1561  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1324  isopropylmalate isomerase large subunit  65.73 
 
 		 464 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4999  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  64.11 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.653294  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0278  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 		 469 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1671  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 456 aa  611  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1549  isopropylmalate isomerase large subunit  62.18 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269438  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08740  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.34 
 
 		 484 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000460564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1961  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 474 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3550  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.87 
 
 		 456 aa  609  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1591  isopropylmalate isomerase large subunit  64.57 
 
 		 473 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.777227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2848  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.93 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.99 
 
 		 465 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2133  isopropylmalate isomerase large subunit  62.77 
 
 		 456 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2096  isopropylmalate isomerase large subunit  62.77 
 
 		 456 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0422  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.68 
 
 		 471 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  63.08 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4441  isopropylmalate isomerase large subunit  62.18 
 
 		 471 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  62.37 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1478  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.17 
 
 		 486 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.333411  normal  0.827202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  61.34 
 
 		 481 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8049  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.93 
 
 		 468 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2802  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  63.82 
 
 		 462 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  0.228539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09060  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.94 
 
 		 471 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0185  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.42 
 
 		 468 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.08009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1258  isopropylmalate isomerase large subunit  60.55 
 
 		 481 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55744  normal  0.382246 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  61.77 
 
 		 474 aa  594  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  61.99 
 
 		 474 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  60.97 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1534  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.46 
 
 		 468 aa  592  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.706683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  61.29 
 
 		 474 aa  591  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.19 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.42 
 
 		 487 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  61.47 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  60.43 
 
 		 471 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1901  isopropylmalate isomerase large subunit  59.83 
 
 		 481 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  62.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  62.07 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 466 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  61.74 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3215  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.12 
 
 		 477 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.056695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8018  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.4 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  62.29 
 
 		 475 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1149  isopropylmalate isomerase large subunit  59.49 
 
 		 481 aa  586  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000597548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  62.29 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.52 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  62.23 
 
 		 466 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  62.85 
 
 		 478 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2256  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000783708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  61.85 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1921  isopropylmalate isomerase large subunit  59.83 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2519  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 484 aa  586  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  59.83 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  62.2 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  60.61 
 
 		 466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1358  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.44 
 
 		 477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  61.08 
 
 		 476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1113  isopropylmalate isomerase large subunit  61.71 
 
 		 465 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.681996  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  60.61 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  61.08 
 
 		 476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  62.2 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  61.08 
 
 		 476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  61.42 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13003  isopropylmalate isomerase large subunit  60.26 
 
 		 473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  60.61 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1573  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.87 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  61.34 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  61.21 
 
 		 466 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  61.31 
 
 		 472 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  60.82 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  60.52 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>