More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0130 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
146 aa  285  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  95.89 
 
 
146 aa  275  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  86.3 
 
 
146 aa  249  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  85.62 
 
 
146 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  85.62 
 
 
146 aa  248  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  85.62 
 
 
146 aa  248  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  79.45 
 
 
146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  79.45 
 
 
146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  75.34 
 
 
146 aa  216  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 
146 aa  209  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  71.23 
 
 
144 aa  207  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  76.03 
 
 
146 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  71.43 
 
 
147 aa  205  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 
144 aa  204  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  68.49 
 
 
146 aa  199  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  70.55 
 
 
146 aa  196  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 
146 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  68.49 
 
 
146 aa  190  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  187  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 
146 aa  187  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 
146 aa  187  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  68.03 
 
 
147 aa  187  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  65.31 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  65.75 
 
 
146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  68.03 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  64.63 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 
147 aa  179  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 
147 aa  179  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  63.7 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  63.95 
 
 
147 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  64.38 
 
 
146 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  62.59 
 
 
147 aa  173  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  63.01 
 
 
147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  59.15 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  65.54 
 
 
159 aa  169  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
153 aa  167  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  60.69 
 
 
149 aa  167  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  58.5 
 
 
148 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  59.86 
 
 
153 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  58 
 
 
153 aa  164  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  65.83 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 
147 aa  161  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  58.9 
 
 
145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
145 aa  159  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
146 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  60.54 
 
 
146 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  57.14 
 
 
150 aa  155  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  58.5 
 
 
149 aa  154  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  55.41 
 
 
148 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  59.59 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  56.25 
 
 
147 aa  153  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  53.42 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 
152 aa  149  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  55.78 
 
 
148 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
176 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  56.76 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  51.63 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  55.56 
 
 
170 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 
144 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
159 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
159 aa  143  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  55.41 
 
 
148 aa  142  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  49.01 
 
 
162 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  54.79 
 
 
172 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  53.38 
 
 
152 aa  141  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  57.04 
 
 
145 aa  140  5e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  48.37 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  53.38 
 
 
149 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
150 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
150 aa  136  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 
161 aa  136  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  56.55 
 
 
157 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
167 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  55.41 
 
 
151 aa  135  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  51.97 
 
 
173 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  54.73 
 
 
150 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
147 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  53.95 
 
 
164 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  50.99 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  48.03 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
169 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
169 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
162 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>