More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1833 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
327 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.2 
 
 
327 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  81.71 
 
 
328 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.54 
 
 
327 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.23 
 
 
327 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.15 
 
 
326 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.73 
 
 
328 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 
330 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
331 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
331 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
329 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 
330 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 
329 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 
329 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
329 aa  381  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
329 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 
329 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 
329 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
332 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
359 aa  371  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
324 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 
329 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 
327 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
326 aa  345  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
331 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
348 aa  332  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
340 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
340 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
373 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
323 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
333 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
323 aa  311  9e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
342 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
323 aa  309  5e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
354 aa  306  3e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
337 aa  302  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
406 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
400 aa  295  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
404 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  43.9 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
327 aa  279  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
405 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
331 aa  277  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
404 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
330 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 
400 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
352 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
400 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
400 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.4 
 
 
405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 
404 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
400 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
400 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 
391 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 
400 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
405 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
400 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
351 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
400 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
404 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
346 aa  246  3e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
392 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
400 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 
404 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
333 aa  238  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
391 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.73 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.67 
 
 
346 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.9 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
356 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>