More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3823 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  91.79 
 
 
1523 aa  2766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 
1268 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1523 aa  3101    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  44.75 
 
 
1162 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  36.35 
 
 
785 aa  278  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  40.05 
 
 
1435 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 
669 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
1340 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  47.81 
 
 
342 aa  213  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  44.03 
 
 
369 aa  204  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  34.98 
 
 
1119 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1852  glycosyl transferase family 2  45.49 
 
 
825 aa  175  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
616 aa  162  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
615 aa  154  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
457 aa  152  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  41.48 
 
 
219 aa  152  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
677 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 
1562 aa  151  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
228 aa  147  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  47.37 
 
 
216 aa  146  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  41.14 
 
 
215 aa  143  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
616 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
414 aa  141  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  45.45 
 
 
199 aa  141  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 
797 aa  140  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.64 
 
 
229 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
624 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
679 aa  136  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
421 aa  135  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  36.46 
 
 
229 aa  135  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
280 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
646 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  37.08 
 
 
229 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
640 aa  133  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.57 
 
 
229 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  35.05 
 
 
229 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  47.02 
 
 
229 aa  132  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  36.08 
 
 
229 aa  132  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
270 aa  129  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
419 aa  128  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
680 aa  127  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
817 aa  125  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
657 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 
826 aa  122  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.76 
 
 
2401 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
1317 aa  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  42.44 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
1256 aa  121  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  32.89 
 
 
1444 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
444 aa  120  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
337 aa  118  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  36.63 
 
 
681 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 
303 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
1314 aa  117  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
305 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
499 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.88 
 
 
723 aa  115  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
298 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
996 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
360 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
1739 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 
1287 aa  113  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.23 
 
 
700 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  40.36 
 
 
444 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
211 aa  112  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
814 aa  112  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
385 aa  112  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  38.97 
 
 
754 aa  112  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
746 aa  112  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
1312 aa  112  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  40.96 
 
 
581 aa  112  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.98 
 
 
320 aa  111  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
396 aa  110  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
392 aa  109  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
391 aa  109  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
415 aa  108  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
1600 aa  108  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  35.53 
 
 
746 aa  107  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
302 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
300 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
438 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
392 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
397 aa  106  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
289 aa  105  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
506 aa  105  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
585 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
312 aa  105  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
633 aa  105  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
334 aa  104  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
1077 aa  103  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
311 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3255  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
1009 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.71 
 
 
427 aa  103  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2866  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
1009 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.715807  hitchhiker  0.00303545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>