56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6661 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  67.63 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  63.31 
 
 		 351 aa  424  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  65.47 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  51.64 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  50.15 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  53.5 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  51.34 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  48.96 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  52.54 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  48.36 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  48.06 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  49.11 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  49.25 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  49.55 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  43.41 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  48.36 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  50.99 
 
 		 323 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  48.96 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  48.82 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 377 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  23.4 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  38 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  23.64 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  31.06 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  21.48 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  24.68 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 383 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  21.79 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  22.51 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  23.41 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  21.4 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  21.4 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  22.75 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  30.23 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  27.56 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  30.73 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  30.73 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  30.23 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.99 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  32.56 
 
 		 838 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  24.15 
 
 		 446 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>