More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1155 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  79.75 
 
 		 246 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  65.37 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.25 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 230 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 231 aa  278  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  62.01 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  60.53 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.34 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.38 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  60.26 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  63.32 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.63 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.34 
 
 		 229 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  58.95 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 224 aa  248  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.66 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  53.51 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 406 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.02 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.87 
 
 		 223 aa  221  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  49.12 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  49.57 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  51.93 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.34 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  50.64 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.51 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  47.37 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  52.05 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.09 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  45.65 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  44.83 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  48.5 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.78 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.31 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  46.52 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.83 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  44.44 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.74 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  48.47 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>