104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0715 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 1036 aa  1969    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  26.48 
 
 		 468 aa  114  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  25.73 
 
 		 403 aa  98.2  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  25.73 
 
 		 403 aa  98.2  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  30.17 
 
 		 361 aa  92  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  27.66 
 
 		 330 aa  91.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  43.24 
 
 		 784 aa  85.5  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  27.33 
 
 		 441 aa  84.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  27.84 
 
 		 416 aa  83.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  23.13 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  50 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  46.75 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  59.18 
 
 		 424 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  47.22 
 
 		 932 aa  76.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  27.71 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  25.81 
 
 		 400 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  25.59 
 
 		 400 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 255 aa  73.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  39.53 
 
 		 413 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  26.04 
 
 		 318 aa  67.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  22.97 
 
 		 673 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  22.22 
 
 		 946 aa  65.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  37.1 
 
 		 935 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  24.75 
 
 		 434 aa  62  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  42.31 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  37.84 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.29 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  42.55 
 
 		 485 aa  60.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  20 
 
 		 1235 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  47.73 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  40.3 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0519  S-layer domain protein  49.06 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28861  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  46.15 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  39.06 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  39.39 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0534  S-layer domain-containing protein  47.17 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00470893  normal  0.0913053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  44.23 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  39.39 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  44.23 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3321  S-layer domain-containing protein  42.86 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  35.21 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  20 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  39.44 
 
 		 458 aa  57.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  45.83 
 
 		 225 aa  57.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  38.36 
 
 		 461 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.76 
 
 		 518 aa  57  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.15 
 
 		 528 aa  57  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  38.36 
 
 		 461 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.28 
 
 		 470 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  31.76 
 
 		 524 aa  56.2  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  45.28 
 
 		 470 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  38.36 
 
 		 461 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  48.89 
 
 		 604 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  41.51 
 
 		 506 aa  56.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  48.94 
 
 		 521 aa  56.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  38.36 
 
 		 461 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  31.76 
 
 		 475 aa  55.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.4 
 
 		 459 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  38.36 
 
 		 189 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  43.4 
 
 		 470 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  31.76 
 
 		 514 aa  55.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.4 
 
 		 459 aa  55.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  47.06 
 
 		 576 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  24.42 
 
 		 186 aa  55.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  47.06 
 
 		 577 aa  55.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  47.06 
 
 		 578 aa  55.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  31.76 
 
 		 513 aa  55.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  31.76 
 
 		 500 aa  55.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  47.06 
 
 		 577 aa  55.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  22.09 
 
 		 404 aa  55.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  22.09 
 
 		 404 aa  55.5  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  39.29 
 
 		 1821 aa  55.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.76 
 
 		 510 aa  54.7  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  31.76 
 
 		 561 aa  54.7  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  37.78 
 
 		 1710 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  38.36 
 
 		 461 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  34.21 
 
 		 288 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0852  S-layer domain-containing protein  45 
 
 		 214 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  44.19 
 
 		 629 aa  52.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 692 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0234  S-layer protein  29.73 
 
 		 241 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  40.43 
 
 		 531 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  39.22 
 
 		 857 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  30.85 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  20.07 
 
 		 1153 aa  52.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.71 
 
 		 447 aa  52  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  32.29 
 
 		 581 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  32.29 
 
 		 581 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  44.68 
 
 		 379 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1012  hypothetical protein  25.3 
 
 		 627 aa  49.3  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 376 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  42.55 
 
 		 376 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  33.77 
 
 		 756 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  21.47 
 
 		 702 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  18.5 
 
 		 2228 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  22.24 
 
 		 7659 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>