49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0295 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0295  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 464 aa  942    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1240  extracellular solute-binding protein  71.67 
 
 		 465 aa  682    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0090  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.44 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  32.45 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  29.3 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.18 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 435 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 447 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 414 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  20.74 
 
 		 454 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 458 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 925 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.39 
 
 		 416 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>