205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0156 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0156  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000017852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  37 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0326359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1029  phosphate uptake regulator, PhoU  30.49 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1091  phosphate uptake regulator, PhoU  30.49 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  26.73 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  27.32 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  26.34 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  26.24 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.85 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  26.73 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  26.73 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  25.94 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  25.93 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  28.09 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  25.73 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  25.23 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  25.25 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  23.44 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  30.39 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  25 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.65 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  23.58 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  24.76 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  24.64 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  24.65 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  25.89 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  28.65 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  29.1 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  27.81 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  25.49 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  24.15 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  24.76 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  23.33 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  23.3 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  23.3 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  25.37 
 
 		 232 aa  62  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  25.51 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  25.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  29.07 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  21.9 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  25.41 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  23.44 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  28.42 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  24.61 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  25.13 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1920  phosphate uptake regulator, PhoU  22.33 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  27.89 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  22.86 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  23.74 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  25.59 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.89 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  22.94 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  22.34 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  28.42 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  22.27 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  26.83 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  22.27 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.07 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  22.27 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  27.63 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  24.06 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  28 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  22.71 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  23.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  24.19 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  26.21 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  23.79 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  24.77 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  26.97 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  22.12 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  21.74 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  23.08 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  25.77 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  26.11 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  24.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  21.95 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  24.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  24.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  24.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  21.76 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  24.41 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  23.81 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  21.74 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  27.63 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  24.24 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  25.81 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  23.7 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>