More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0745 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.58 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.58 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.58 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.13 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  40.1 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  36.41 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  36.23 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  39.22 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  37.16 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.8 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  38.76 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  36.23 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.27 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  36.24 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  36.92 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  34.39 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  37.27 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  37.75 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  36.65 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.18 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1029  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1091  phosphate uptake regulator, PhoU  32.26 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.861563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  32.67 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  34.45 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  34.6 
 
 		 253 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.48 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  31.46 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.12 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  34.12 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.27 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 256 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  33.98 
 
 		 242 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  33.97 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.98 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.98 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  33.49 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.98 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  36.23 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  32.68 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>